Il trapianto fecale microbiotico è una pratica medica efficace in pazienti soggetti a ripetute infezioni da Clostridium difficile. Questa pratica, tuttavia, presenta il rischio di sovrainfezione da altri batteri quali Escherichia coli antibiotico-resistenti, non eliminabili nel campione fecale trapiantato. La nuova pillola SER-109, di Seres Therapeutics, propone una soluzione alternativa, in quanto è stata creata purificando microbi da feci umane con un protocollo disegnato per eliminare funghi e batteri, mantenendo principalmente batteri in grado di formare spore del phylum dei Firmicutes. Uno studio clinico di fase 3 pubblicato su The New England Journal of Medicine ha mostrato che nei pazienti trattati con SER-109 e antibiotico per 8 settimane a seguito di infezione con C. difficile si infettavano solo per il 12% contro il 40% di infezioni nei pazienti trattati con il placebo.
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